實驗診斷科於B棟2樓，除了一般業務外，也接受勞工體檢、學生體檢、全民健保成人健康檢查等，以及代檢服務、代訓服務、臨床檢驗諮詢、學生實習教學、輔導雲林縣檢驗品質，與辦理衛生福利部預防保健工作：新生兒先天代謝疾病篩檢G-6-PD 缺乏症確認檢查。
作業時間與聯絡電話如下：
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檢驗單位
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分機
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服務時間
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抽血櫃檯
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2802
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週一至週五07：30~21：00
週六 07：30~13:30
其他時間：按鈴服務
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鏡檢室
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2801
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24小時
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血液室
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2803
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24小時
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血庫室
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2804
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24小時
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生化室
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2805
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週一至週五08：00~17：30
週六08：00~12:00
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心電圖室
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2808
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24小時
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血清室
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2806
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週一至週五08：00~17：30
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細菌室
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2807
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週一至週五08：00~17：30
週六08：00~12:00
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