企畫室在經過組織的調整後，目前設有企畫公關組、研考組及醫品病安組等單位，並在同仁的分工與通力合作下，完成許多艱困的任務與挑戰，創造若瑟的驕傲與榮耀。
企畫室的工作與醫院都息息相關，舉凡醫院營運規劃、院內外各項專案評估、各項醫療合約管理、衛生局協調事項、新聞發佈及全院品質推動...等，均有賴同仁之間的相互合作與努力才能持續推動與發展。
企畫室全體同仁將不斷提昇專業知識與技能，以更積極的態度與創新的思維，在未來的歲月與生活中，繼續揮共同創造若瑟的驕傲與榮耀。
企畫公關組：
負責對外公關、行銷相關業務規畫與執行，包含新進醫師宣傳、影片拍攝、電台／電視台專訪事宜；規劃及辦理全院經管理管共識營活動；醫訊、門診時間表執行編輯；辦理記者會、媒體聯繫及新聞採訪發佈等事項；全院公播系統、電子公告、走馬燈及海報審核及張貼之管理；追蹤及稽查全院委員會會議紀錄管考事項；協助社區業務推展事宜及院史文物資料整理及院史廊陳列展示。
研考組：
負責院際間醫療合作事宜；經營分析與策略管理的初步分析；負責規劃及擬訂醫院近、中、長程目標；列管重大工作項目之追蹤與管考；年度計畫編審作業；追蹤年度計畫執行管制與成效之評核；重大、高價儀器採購效益分析；擔任及協助醫療科業務發展；辦理建教合作、長期機構合作事宜；辦理緊急醫療能力分級、特殊照護中心評定事宜；負責協助醫療科業務推展及經營成效分析；負責教學獎勵金考核彙整之事宜及負責相關專案推動及管理。
醫品病安組：
研擬、執行、追蹤、稽核全院醫療品質、病人安全行政作業；台灣醫療照護品質指標系列(THIS)、醫院評鑑持續性監測指標、醫院品質績效量測指標系統與落實品質改善計畫(P4P)之指標定期提報作業(指標蒐集、單位協調、資料彙整、內部及外部系統登錄)；全院各單位品質指標建置及指標相關品質改善方案追蹤；舉辦品質促進及病人安全相關教育訓練；研擬、執行品質促進相關事項，協助及輔導院內品管圈、專案…等品質促進活動，協助院內優秀團隊參加全國競賽； ISO9001定期追查、驗證準備(合約、進度跟催)單位協調及問題處理；流程再造(ISO程序書編訂)、全院程序書審查作業、版本控管、線上發行；研擬、執行ISO9001內部稽核計畫及複查作業，製發及追蹤改善行動方案；醫院評鑑籌劃(任務編組、權責、條文分工、準備時程)、資料彙總及填報作業、不定期追蹤輔導訪查作業，及協助醫院評鑑暨教學醫院評鑑實地評鑑相關事項；病人安全通報事件管理(校正、收案、陳核)、報表統計(週報表、月報表、季報表、年報表)、製發及追蹤改善行動方案(含RCA)、上傳醫策會TPR系統、通報獎勵統計及發放作業；研擬病人安全工作目標推動計畫、病人安全工作目標之確立、病人安全工作目標執行計畫及成果彙總；病人安全活動規劃及推廣(辦理病人安全週活動、醫病共享決策、其他非常態舉辦活動)；病人安全滿意度調查(問卷製作、發放、建檔、分析)、改善結果追蹤；維護及管理醫院評鑑系統、 BIKM品質指標系統、行政簽核系統-病人安全通報及維護文件管制中心、病人安全資訊網網站。