為因應醫療環境及保險給付制度之變遷 ，本院將原有之病歷、批價、及公勞保等相關業務單位 ，整合為一個系統單位─醫療事務部 。
醫療事務部隸屬於行政副院長管轄 ，設有主任一名 ，副主任一名 。下設有保險申報組、收費業務組、病歷資訊管理組共三組 。主要業務係以病人到院就醫所發生之醫療相關事務:提供病人就醫資料、住院期間各項手續及收費業務 ，及事後向健保局申請醫療費用核付等作業 。
 

一、病歷資訊管理組
負責現有病歷管理。工作內容為：病歷抽調、傳送、歸檔、借閱、入出庫作業、未完成病歷追蹤及獎懲作業、出院病歷排序整理合併、病歷『量』的審查、『質』的抽樣審查作業及超厚、不活動病歷整理 。

二、收費業務組
負責門急診掛號、收費作業、住院患者醫師開立之醫囑電腦登入作業及病人住、出院期間各項手續及收費作業；另外亦負責相關單位補助費用請款及協助院內各科自費收費項目之修訂 。

三、保險申報組
組內分為門診組、住院組及疾病分類組 。主要負責所有門診、住院健保申報相關業務 ，並為本院與健保局聯絡之窗口 。