資訊室由最初編制1人的電腦室，經過27年的努力，逐漸演變成有13人之工作團隊。於最初1988年成立迄今，隨著內外部環境不斷的改變，經歷第1階段系統草創期、第2階段基礎建置期、第3階段穩定發展期，目前資訊室結合內外部資源，在院方給予的支持及內部團隊的專業能力努力下，持續提供就診民眾及院內員工更優質的資訊服務。

1988年至1997年間為第1階段系統草創期，透過醫療資訊系統委外開發，使用NEC 3100/A90 Model, MINI型專屬電腦系統，範圍包括門診和住院相關系統，後續軟體維護和新系統開發的工作，則由資訊室接手。期間隨著勞保甲乙丙表實施、全民健保開辦等保險制度的不斷變更，系統程式亦隨之調整，經過幾度翻修，系統生命週期已到了極限。再加上當時系統將遭遇Y2K問題，情況迫在眉睫須盡速尋求對策。經過半年評估與調查，並考量資訊室成員技術與醫療專業能力的提昇，於1997年中決定重新開發系統，採用開放性系統兩層（Client / Server）架構自行開發。

1998年第2階段基礎建置期，系統開發期間依當時4人的既有人力，將門診和住院等基礎系統分2次上線，其他系統則於1999年之後陸續上線。在經歷「全民健保上線」和「Y2K系統更新」的兩大重大轉折事件，使得醫療資訊系統的應用從縱向的延伸到橫向擴充都到達了一定的應用的程度，也奠定了若瑟醫療資訊系統完整的基礎架構。並於2001年在CHCA成功發表門診診間醫令系統，以簡易操作、人性化介面等優點獲得相當的肯定，因此若瑟醫療資訊系統也獲得多家醫院的採用。

在若瑟50周年未來展望的自我期許中，第3階段穩定發展期中我們完成了以下重大系統的建置。
一、完成PACS系統建置。
二、完成並持續推動 ISO27001資訊安全認證。
三、完成住院醫令系統、護理資訊系統並持續擴充相關功能。
四、完成門診處方、出院病摘、醫學影像、檢驗、護理資訊系統等單張之電子病歷簽章。
五、為使醫師快速掌握醫療資訊及無紙化目標，透過各系統資訊彙集完成病歷彙整查詢作業。
六、完成WEB介面公用性系統包括線上資訊系統、醫院評鑑系統、數位學習平台、行政簽核系統、內訓系統等系統建置。

適逢醫院60周年，回顧過去醫院資訊化的過程，在院方的支持和資訊室同仁的努力之下，以有限的資源獲致目前的成果，但在資訊環境不斷的快速變化之下也期盼有更多資源投入資訊相關系統的建置，提供更友善及完整的服務。

展望未來在醫療資訊應用，第一、在醫院財務狀況及資訊安全的考量下，建置更完善的行動醫療服務，提供病患更好的服務。第二、持續將公用性系統轉移或建置為WEB介面系統。第三、持續導入電子病歷，第四、將持續推動資訊安全環境更新建置和強化資訊安全教育。希望若瑟醫療資訊系統在安全穩定中提供員工及病患最好的服務。